始于1904年的日俄战争标志着非西方国家第一次战胜西方列强。史学家认为，作为胜利者的日本由此气焰高涨，日后的珍珠港事件及美日太平洋战争也是其间接后果。“日俄间的军事冲突在西伯利亚铁路建设期间真正爆发。”德国杜伊斯堡·埃森大学俄罗斯历史系副教授伊娃·玛丽亚·施托尔贝格在论文《日俄战争不能离开西伯利亚孤立研究》中写道。1891年，当俄罗斯施工队的铁锹挖开西伯利亚的冻土，明治维新后国力迅速上升的日本立刻感到了不安。日本决策者认为，在西伯利亚铁路开始建设前，沙皇俄国的主要活动集中在欧洲，这条铁路的动工则表明，“北极熊”将目光转向了东方。“只要俄罗斯依旧将重心放在欧洲，就不会对日本的领土扩张计划构成威胁。”历史学者菲利克斯指出，“而西伯利亚铁路的动工令日方大为紧张。”此后5年，时任俄财政部长谢尔盖·维特的动作，进一步刺激了东京的神经。作为战胜国，日本开启了野心勃勃的扩张之路；担心自己在亚洲利益受损的美国，则开始将日本定义为头号假想敌。世界格局的连番变化，都与西伯利亚铁路有关。沙俄在战场上的失败，一定程度上也是它修路太慢导致的。俄陆军部长阿列克谢·库罗帕特金战后总结称：“铁路的限制令我们无法顺利从西部转移部队和物资，从而造成东北亚地区防守薄弱。”汗和血成就沙皇的梦想西伯利亚铁路的修建过程中发生过不少逸闻趣事。在莫斯科、资源丰富的西伯利亚地区和太平洋沿岸间架起铁轨的提议早在19世纪50年代就被提出，但资金和技术的掣肘让计划延迟了数十年。此间，海外投资者曾对建设西伯利亚铁路表现出浓厚兴趣，但沙俄政府不愿放“外人”插手如此重要的战略性工程。
起初，西伯利亚铁路有个更形象的名字——“伟大的西伯利亚之路”，为了筹得建造这条“伟大之路”的资金，维特增加税收、狂印钞票。俄财政部也锱铢必较，甚至不惜“偷工减料”。例如，减少用于铁路路基的道砟，削减枕木数量，小型桥梁用木头，而非钢铁搭建……彼时，工期一拖再拖，成了为数不多的工程师们的噩梦。1903年，第一列火车开上了西伯利亚铁路，车厢中有着森严的等级制度。在头等舱，贵族们享受着奢华的服务，图书馆、健身房、贴着大理石的浴室一应俱全，餐厅供应昂贵的鱼子酱，还有三角钢琴的伴奏。而在车厢另一头，打工者和货物挤在一起。
