SQL Server 是Microsoft 公司推出的关系型数据库管理系统。具有使用方便可伸缩性好与相关软件集成程度高等优点，可跨越从运行Microsoft Windows 98 的膝上型电脑到运行Microsoft Windows 的大型多处理器的服务器等多种平台使用。
MySQL是一个关系型数据库管理系统，由瑞典 MySQL AB 公司开发，目前属于 Oracle 旗下公司。
2、发行费用区别
MySQL不全是免费，但很便宜。SQL Server是微软推出的商用数据库系统，是微软的软件，所以贵些。
3、适用的场景区别
MYSQL适合小、中型网站，对于不是特别大流量的网站，效率好。SQL Server一般是企业级的商务网站使用的。
4、是否开源的区别
MySQL和SQL Server最大的区别就是MySQL是开源的。
5、安全功能：
MySQL有一个用于改变数据的二进制日志。因为它是二进制，这一日志能够快速地从主机上复制数据到客户机上。即使服务器崩溃，这一二进制日志也会保持完整，而且复制的部分也不会受到损坏。在SQL服务器中，也可以记录SQL的有关查询，但这需要付出很高的代价。
6、恢复性:
恢复性也是MySQL的一个特点，这主要表现在MyISAM配置中。这种方式有它固有的缺欠，如果你不慎损坏数据库，结果可能会导致所有的数据丢失。然而，对于SQL服务器而言就表现得很稳键。SQL服务器能够时刻监测数据交换点并能够把数据库损坏的过程保存下来。
7、选择方面：
根据需要决定选择。如果想建立一个.NET服务器体系，这一体系可以从多个不同平台访问数据，参与数据库的管理，那么可以选用SQL服务器。如果想建立一个第三方站点，这一站点可以从一些客户端读取数据，那么MySQL将是最好的选择。
