传统上的常规做法是：
系统级的组件放在/bin、/lib；根用户才能访问的放在/sbin；系统repository提供的应用程序放在/usr/bin、/usr/lib；用户自己编译的放在/usr/local/XXX。现在有一些变化，在大约两年前，大量linux系统都将/bin、/lib弄成/usr/bin、/usr/lib的符号链接。此外，不同系统还会有很多的细微区别，比如Redhat系喜欢把32位的库放在/lib、/usr/lib，64位的库放在/lib64、/usr/lib64，而Debian系喜欢把平台相关的那层名字放在/lib、/usr/lib的子目录里，比如/usr/lib/x86_64-linux-gnu/。然后，各种配置文件的文件名、路径也会有区别，比如ssh服务器的配置文件可能叫/etc/ssh/sshd.conf，也可能叫/etc/ssh/sshd_config。。。分成三块的最早的渊源，据说是这样的：Unix开发者的机器的硬盘不够了，新加了一块，挂在/usr上；又TM不够了，再加一块，挂在/usr/local上；不知怎么，就变成规范了。。。。
