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三代测序之微生物基因组 de novo 测序

时间:2024-07-01 06:04:02

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三代测序之微生物基因组 de novo 测序

三代测序之微生物基因组 de novo 测序

-05-20编辑:诺禾致源

微生物基因组de novo测序

产品优势

•单分子,长序列,完美跨越细菌全部重复单元

•真菌 20Kb 文库,70× 数据组装,组装效果直达准染色体级别

•个体比较加进化分析,多角度挖掘基因组编码内涵

•多样化的专业后续分析方案,一步到位直奔研究目标

研究方案

研究案例

单分子实时测序技术绘制结核分枝杆菌复合群甲基化图谱

结核分枝杆菌复合群(MTBC)引起的肺结核是遗留的最常见的感染性疾病之一。作者利用单分子实时测序技术完成了来自 MTBC 不同谱系12个菌株的基因组测序和甲基化位点解析(如图4)。

图4 三代修饰图在细菌基因组中的应用

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甘蔗鞭黑粉菌完成图及其与甘蔗的互作转录组

甘蔗鞭黑粉菌是甘蔗的一种常见真菌病原体,作者使用 PacBio 测序平台对菌株进行测序,组装至59条 Contig 的准染色体级别,并基于近缘参考基因组构建了菌株的染色体序列(如图5)。

图5 三代真菌准染色体组装案例

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