Discovery studio使用之DNA建模

DNA建模通常是利用3D-DART, 但是现在3D-DART网站已经无法进入。如果还想用它进行DNA建模，需要通过docker container去运行它:

/haddocking/3D-DART-server/

这里介绍如何利用Discovery studio软件对DNA进行建模。

Tools—>Macromolecules—>Build and Edit Nucleic Acid

左边设置中可以选择DNA的延伸方式（默认为向3‘端延伸），DNA类型（单链还是双链），构象（A/B/Z）

例：

Build Action: Create/Grow at 3’

Nucleic Acid Type: DNA-Duplex

Conformation: B Helix

设置好后可点击A G C T…依次为核苷酸建模，

也可以点击Specify Residues直接输入序列文本。