简介
基因表达调控机制是后基因组时代一个重要的研究内容。其中，转录因子通过特异性结合调控区域的DNA序列来调控基因转录过程。转录因子(Transcription Factors，TFs)，是指能够以特定序列与基因专一性结合，从而保证目的基因以特定的强度在特定的时间与空间表达的蛋白质分子。转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色质和转录，以形成指导基因组表达的复杂系统。许多转录因子充当着主调节因子和选择基因的角色，控制着细胞类型的决定、发育模式和特定途径控制(如免疫反应)的过程。转录因子结合位点（Transcription factor binding site，TFBs）是与转录因子结合的DNA片段，长度通常在5-20bp范围内，一个转录因子往往同时调控若干个基因，而它在不同基因上的结合位点具有一定的保守性，但又不完全相同。理解转录因子与结合位点间的相互作用是理解转录调控机制，构建转录调控网络的关键所在。
生物信息学在转录因子研究中的应用
通过实验方法分析难以完成对海量基因组非编码区序列的功能研究。随着人类基因组及多个模型动物基因组测序工作的完成，以及各种分析程序的不断完善，计算机辅助进行分析的方法-生物信息学方法已越来越广泛地应用于该领域。大量的实验和计算结果表明，生物信息学方法可以从大量的非编码区中成功筛选出转录调控元件为进一步实验提供指导方向。随着基因组序列信息的日益丰富，计算方法和数据库的不断完善，生物信息学的应用将日益广泛，基因组序列中的转录因子也将逐步得到阐明。
