1、待避：等级低的列车中途要避让等级高的列车，特别是动车组开行后，原先的一些“王牌”特快也都因为待避动车组慢了。而且待避多趟列车时停留的时间也会长，晚点时间也就长。
2、中途图定停留时间短，但实际上因旅客多，装卸行李等原因，造成列车不能正常发车以致每站都晚开几分，最后到达终点站时晚点达到一小时多。
3、线路原因：如遇线路维修，施工的天窗点时，列车会减速通过甚至特殊情况下会停车等待，造成一定的时间消耗。
4、运行事故：列车机车，车体出现在问题，以及列车在运行时发生撞人事件事，需要一定时间处理事故，也会造成晚点。
5、天气原因：如雪灾、洪水等。
