1、选用抗病品种。可选用抗病苏蜜、抗病苏红宝、京抗2号，京欣2号，郑抗2号、郑抗3号等抗病耐病品种。
2、种子消毒。播种前可采用①温汤浸种法：在55--60℃温水中浸种20分钟；②药液浸种：40%甲醛150倍液浸种30分钟，或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液浸种1小时；③药剂拌种，以干种子重量的0.20%--0.30%的敌克松、拌种双或多菌灵拌种。
3、嫁接防病。西瓜枯萎病有明显的寄主专化性，采用嫁接法防病效果显著。西瓜嫁接常用的砧木有：瓠瓜、超丰F1、葫芦等。葫芦砧和瓠瓜砧与西瓜嫁接亲和性较好，嫁接苗成活率高。嫁接的方法有靠接、插接、劈接、断根接等。嫁接成功的关键是培育壮苗和嫁接后3--5天的保湿保温。
4、土壤处理。育苗应选用韭菜地、非瓜田土，加肥料配成营养土，并用营养钵护根育苗。大田土壤要深翻晒垄，重茬田采用移沟法对阴阳土进行交换。酸性土壤可施用消石灰或喷洒石灰水。有西瓜枯萎病史的田块播前用五氯硝基苯、多菌灵，敌克松杀菌剂喷洒瓜沟或将药土施入播种穴，进行土壤消毒。
5、农药防治。定植后结合浇定根水进行药剂灌根。发病初期药剂灌根，可用70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液，或15%粉锈宁可湿性粉剂2000倍液，或20%甲基立枯磷乳油400倍液等，隔5--6天上次，连灌2--3次。每次每株用药液250毫升。发病初期也可用敌克松与面粉按1：20配成糊状，涂于病茎基部，也有一定防病作用。
