辣椒病毒病是植株病毒所引起的系统性侵染病害，其毒源植物分布很广，土壤和种子均可带毒，成为初次浸染源。定植、整枝、打杈等田间操作是烟草花叶病毒的传播途径，通过磨擦将病株毒源传给健株；蚜虫迁飞和危害是黄瓜花叶病毒的主要传播途径。品种间发病程度差异较大，一般辣味椒较甜味椒抗病，果实尖的或锥形品种较灯笼形品种抗病。另外，导致植株抗病性减弱的气候条件（高温干旱）、缺钙钾等因素均易导致该病发生。
春、秋两季均有发生，以秋辣椒、秋延后辣椒发病最重。
要做好蚜虫的防治工作，减少病毒病传播。
辣椒病毒病发生后造成辣椒"三落"(落花、落叶、落果)，田间症状十分复杂。最常见的有两种类型，其一为斑驳花叶型，所占比例较大，这一类型的植株矮化，叶片呈黄绿相间的斑驳花叶，叶脉上有时有褐色坏死斑点，主茎和枝条上有褐色坏死条斑。植株顶叶小，中、下部叶片易脱落。其二为黄化枯斑型，所占比例较小，植株矮化，叶片褪绿，呈黄绿色、白绿色甚至白化。植株顶叶变小，狭长，中、下部叶片上常生有褐色坏死环状斑(褪绿变黄的组织上由许多褐色坏死小点组成环状斑)，有时病斑部开裂，病叶极易脱落。后期腋芽抽生丛簇状细小分枝。
