番茄根腐病病菌以菌丝体和分生孢子器随病残体在土壤中越冬，也可以在没有充分腐熟的堆肥中越冬。第二年春天会产生大量的分生孢子并随着雨水、灌溉水或昆虫传播蔓延，从根部或茎基部的伤口处侵入植株体内进行为害。
高温、高湿宜于此病发生。苗床连茬、地面积水、施用未腐熟的肥料、地下害虫多、农事活动造成根部伤口多的地块发病较重。
西红柿根腐病危害主根和茎基部。
病菌在病残体上越冬雨水昆虫传播伤口侵入为害。
病原菌疫霉根腐病的病原菌为寄生疫霉和辣椒疫霉，均属鞭毛菌亚门的真菌，孢子囊在孢子梗上形成孢子囊梗无限生长。由孢子囊和游动孢子引起初次侵染和再次侵染，借雨水和气流传播。在条件适宜时，潜育期短，可引起多次重复侵染，一般在低温多雨、潮湿雾多、昼夜温差大的气候条件下，微酸性土壤中，病害容易流行。
