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痰液标本的核酸阳性检出率高于咽拭子标本?

时间:2021-10-08 03:32:02

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痰液标本的核酸阳性检出率高于咽拭子标本?

痰液标本的病毒核酸阳性检出率或高于咽拭子标本

目前实时逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)诊断试验是确诊COVID-19患者的主要手段,样本采集以咽拭子为主,但容易漏诊,寻找检测效率高、准确度高的样本类型是必要的。

近日,武汉大学中南医院与武汉市金银潭医院在medRxiv平台发文表示,在COVID-19患者诊断过程中痰标本核酸检出率明显高于咽拭子标本。

该研究共招募金银潭医院52名疑似COVID-19患者,所有患者均同时接受咽拭子标本和痰液标本的病毒核酸检测,以作出明确诊断,并比较两种不同标本核酸检测阳性率。

52名患者平均年龄57.3岁,其中男性27名。咽拭子标本的核酸检测结果:阳性23例(44.2%),阴性29例(55.8%);痰液标本核酸检测:阳性40例(76.9%),阴性12例(23.1%)。多数患者对咽拭子标本和痰标本的qRT-PCR检测结果相同,阳性率为36.5%,阴性率为15.4%。而相当一部分患者(40.4%)痰标本呈阳性,咽拭子标本呈阴性,只有极少数患者(7.7%)痰标本呈阴性,咽拭子标本呈阳性。

结果可以看出,痰标本检测的核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本,表明痰液标本或比咽拭子更准确。作者表示,这可能与新型冠状病毒主要侵袭和感染下呼吸道细胞导致咳嗽、肺炎等临床表现有关。

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/content/10.1101/.02.21.20026187v1

肥胖和癌症或是COVID-19的两大易感因素

人血管紧张素转换酶2(ACE2)与SARS-CoV-2具有明显的亲和力,因此ACE2表达量或与SARS-CoV-2的易感性相关。

近日,北京大学研究团队在预印本网站上发表重要结果,表明肥胖和癌症或为COVID-19的两大易感因素。

研究人员利用HCCDB和HPA两个数据库,在正常组织中搜索SARS-Cov-2受体ACE2。从RNA水平上看,ACE2在心脏、肾脏、睾丸、肠和膀胱中的表达均高于在肺中的表达。此外,还发现胆囊和脂肪组织(包括皮下和内脏)中ACE2的表达明显高于肺组织。

由于数据不足,无法检测整个脂肪组织中ACE2的表达,但通过对以前研究的公开数据重新分析,比较了非肥胖和肥胖个体脂肪组织中脂肪细胞和脂肪祖细胞中ACE2的表达水平。结果肥胖者和非肥胖者两种细胞之间ACE2表达水平的结果相似,但是肥胖者组织中的脂肪含量更高,ACE2总量多,因此SARS-Cov-2易感性更高。

同时,利用HCCDB、UALCAN和GEPIA2三个数据库分析ACE2在肿瘤中的表达水平。发现五种癌症的肿瘤组织包括CESC(宫颈鳞状细胞癌和宫颈内腺癌)、PAAD(胰腺癌)、READ(直肠腺癌),KIRP(肾乳头状细胞癌)和KIRC(肾透明细胞癌)表达的ACE2比相邻组织高,尤其是前三种癌症。提示这些癌症部位SARS-Cov-2感染可能更高。

研究人员表示,在COVID-19爆发期间应更多地关注肥胖人群和上述五类癌症患者。

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/manuscript/02.0315/v1

南京市24例无症状传染者的临床特点

先前的研究已经证实COVID-19患者的临床特征以及存在人与人之间传播。但对于无症状感染状态者的数据有限。

近日,南京医科大学研究团队报告了南京市24例与新冠肺炎确诊患者密切接触者但无症状感染的临床特点,探讨了无症状病毒携带者的传播潜力,并在预印本网站Medrxiv发表相关结果。

研究人员于1月28日至2月9日对江苏省南京市COVID患者或疑似患者的密切接触者进行流行病学调查,最终纳入24例密切接触者。通过检测咽拭子样本的核酸,实验室证实无症状携带者对COVID-19病毒呈阳性。回顾他们的临床记录、实验室评估和胸部CT扫描。

结果24例无症状感染者在核酸确诊筛查前均无明显症状。住院期间5例(20.8%)出现发热、咳嗽、乏力等症状。12例(50.0%)表现为典型的毛玻璃胸,5例(20.8%)表现为肺部条纹影。其余7例(29.2%)CT无明显异常,住院期间也无症状。

24例患者均未发生严重COVID-19肺炎或死亡,只出现轻微症状,但从首次核酸检测阳性,到连续两次检测转阴的中位时间却是9.5天,其中最长为21天,意味着他们可能在这期间内把SARS-CoV-2传染给周围的人。通过流行病学调查,他们观察到一种典型的无症状密切接触者将病毒传染给了其他家庭成员,甚至导致严重的COVID-19肺炎。

作者表示,从密切接触者中识别出的无症状携带者在住院期间可能只表现出轻微症状,但是传染期可能长达三周以上,而被传染的人可能会患上严重COVID-19肺炎。这些结果强调了通过病毒核酸试验进行密切接触追踪和纵向监测的重要性。

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/content/10.1101/.02.20.20025619v2

可抑制新型冠状病毒的中草药筛选

虽然特异性疫苗和抗病毒药物是预防和治疗病毒感染的最有效方法,但目前还没有针对SARS-CoV-2的有效治疗方法,此时中药或能提供潜在的宝贵资源。

近日,中国人民解放军海军军医大学(第二军医大学)的研究人员对中草药用生物信息学进行筛选,确定可用于治疗病毒性呼吸道感染的中草药,并且可能含有直接抑制SARS-CoV-2的化合物,为COVID-19患者治疗提供思路。该结果发表于《Journalof Integrative Medicine》。

首先进行文献搜索,寻找已被证实的针对严重急性呼吸综合征冠状病毒或中东呼吸综合征冠状病毒有治疗效果,同时被纳入中药系统药理学数据库的天然化合物。并对满足这两个要求的化合物进行吸收、分布、代谢和排泄(ADME)评估,以验证口服给药是否有效。然后分析该化合物是否具有直接与SARS-CoV-2蛋白相互作用的潜力。最后,采用网络药理学分析方法对所选的每一种中药的体内总效应进行预测。

通过筛选,研究人员找到了13种天然化合物,这13种化合物都能够与SARS-CoV-2中的特定蛋白结合。此外,125种中草药被发现含有这13种化合物中的2种或更多,其中26种中草药可治疗病毒性呼吸道感染,而且网络药理学分析预测,这26种植物在体内的一般作用与调节病毒感染、免疫/炎症反应和缺氧反应有关。

研究人员表示,该研究是为选择潜在的中草药治疗COVID-19提供了一种合理的方法。每种草药的具体剂量和用法仍需要通过标准的临床实验,并根据患者的临床表现确定。

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/science/article/pii/S2095496420300157?via%3Dihub

新冠病毒会对神经系统造成重大伤害

对于COVID-19,一些有不少研究已经描述了临床表现,包括呼吸道症状,肌痛和疲劳。然而,关于COVID-19患者神经系统临床表现还没有相关的研究报道。

近日,华中科技大学研究团队在预印版平台medRxiv上发文,旨在探讨COVID-19患者的神经系统表现,并指出SARS-CoV-2会对人体神经系统造成重大损伤。

研究人员收集到1月16日至2月19日,共214例经实验室确诊被SARS-CoV-2感染的严重急性呼吸综合征患者的电子病历,从中提取临床数据,并由经过培训的医师团队进行审查。

主要观察的神经症状可分为三类:中枢神经系统(CNS)症状(头痛、头晕、意识障碍、共济失调、急性脑血管病和癫痫)、外周神经系统(PNS)症状(减退、低眼压、低眼压和神经痛)和骨骼肌症状。所有神经症状的数据由两名专业的神经科医生进行检查。

结果在214例患者中,重症患者88例,非重症126例。与非重症患者相比,重症患者年龄更大,有更多的潜在疾病,尤其是高血压,表现出更少的典型症状,如发热和咳嗽。所有患者中78例有神经症状,占36.4%。更严重的患者可能有急性脑血管病、意识障碍和骨骼肌损伤等神经症状。

作者表示,SARS-CoV-2会对神经系统造成重大损伤,且与非重症COVID-19患者相比,重症患者常见的神经症状包括急性脑血管病、意识障碍和骨骼肌症状。因此,除了呼吸系统症状外,临床医生还应密切注意患者神经系统表现。

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/content/10.1101/.02.22.20026500v1

COVID-19患者肝损害的临床特点

COVID-19患者经常出现肝功能异常,而相关肝损害的临床特点到底如何?近日,上海市公共卫生临床中心在medRxiv平台发文,阐明COVID-19相关肝损害的临床特点,为临床治疗提供参考。

他们采用回顾性单中心研究方法,对上海市公共卫生临床中心1月20日至1月31日确诊的148例COVID-19患者进行随访研究,随访时间截止到2月19日,并对患者的临床特征、实验室指标(包括肝功能检查)、用药及住院时间进行分析。

结果148例确诊SARS-CoV-2感染者中,女性占49.3%,男性占50.7%,中位年龄为50.5岁。临床表现为发热(70.1%)、咳嗽(45.3%)、咳痰(26.7%)。入院时肝功能异常75例(50.7%)。肝功能指数升高的患者更易出现中度高热,且男性患者明显发热。

肝功能异常组CD4+、CD8+T细胞数量明显低于肝功能正常组。肝功能正常组与肝功能异常组的院前用药无统计学差异。而新发肝损伤患者入院后洛匹那韦/利托那韦的利用率明显高于肝功能正常患者。此外,入院后出现的肝功能异常会导致住院时间的延长。

作者表示,SARS-CoV-2可能引起肝功能损害,治疗COVID-19应慎用洛匹那韦/利托那韦。

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/content/10.1101/.02.26.20026971v2

注意!COVID-19患者康复后仍携带病毒

疫情爆发以来,已经有不少关于SARS-CoV-2的研究,但目前对SARS-CoV-2的研究主要集中在确诊感染患者的流行病学、临床和放射学特征上,对康复患者的研究少之又少。

近日,武汉大学中南医院研究团队对COVID-19康复者进行追踪调查,发现康复出院者同样可能携带病毒,具有传染性。并将结果发表在《JAMA》。

1月1日至2月15日,武汉大学中南医院收治1名住院患者和3名在家接受隔离的COVID-19患者(均为医务人员)治疗,并用RT-PCR检测SARS-CoV-2核酸,确定他们是否能重返工作岗位。

所有4名患者都是通过工作接触并感染SARS-CoV-2。其中两名为男性,年龄在30至36岁之间。3例患者在发病时出现发热、咳嗽或两者同时出现。一名患者最初无症状,由于接触受感染的患者而接受了CT检查而查出。所有患者RT-PCR均阳性,CT表现为磨玻璃样混浊或混合磨玻璃样混浊,病情从轻到中度。

在接受抗病毒治疗后,其中3例患者的临床症状和CT影像学异常均得到了缓解。第四位病人的CT表现为磨玻璃样阴影。4例患者均连续2次RT-PCR阴性。从症状出现到恢复的时间为12~32天。

出院或停止隔离后,患者被要求在家继续隔离5天,5~13天后重复RT-PCR检测,结果均为阳性,使用不同制造商的试剂盒进行额外的RT-PCR检测,结果对所有患者均为阳性。

上述4例COVID-19患者治疗后符合出院或停止隔离的标准(无临床症状和影像学异常,2次RT-PCR阴性),但5~13天后病毒核酸检测却呈阳性。这些发现表明,至少有一部分康复患者可能仍然是病毒携带者。

该研究样本量少,都是轻度或中度感染的患者,进一步的研究应随访那些不是医疗保健专业的人员,以及那些出院或中止隔离后感染更为严重的患者。

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/journals/jama/fullarticle/2762452?resultClick=1

COVID-19患者泪液和结膜分泌物中检测出SARS-CoV-2核酸

最近研究提示不仅粪便中存在SARS-CoV-2,连尿液中都能发现SARS-CoV-2的身影。此外,还有许多医生怀疑患者的泪液或结膜分泌物中也存在着病毒。

近日,浙江大学医学院附属第一医院研究人员发现在新冠肺炎患者样本中有一名存在结膜炎患者的眼泪和结膜分泌物标本中检测到病毒核酸阳性。并在《Journalof Medical Virology》发表研究结果。

该研究纳入了1月26日至2月9日在浙江大学第一附属医院确诊的COVID-19患者,使用结膜拭子技术收集患者的泪液和结膜分泌物,每名患者每隔2-3天抽取两份样本。进行逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测。

其中30名患者普通型21例,重度9例,平均年龄54.50岁,男女之比为7/3。检测结果发现有一例常见结膜炎患者的两份结膜拭子标本的RT-PCR结果呈阳性,其痰标本也呈阳性,其余20例普通型结膜拭子和9例重症结膜拭子均为阴性。

该研究评估了SARS-CoV-2感染患者的泪液和结膜分泌物。最终结果表明,在结膜炎患者的泪液和结膜分泌物中存在病毒,而无结膜炎的标本中没有病毒。

然而,这项研究存在一定局限性。首先,所包含的样本规模相对较小。其次所采集的泪液和结膜分泌物标本有限,其浓度可能不足以检测病毒。作者表示,该研究的现实意义在于提示医务人员在检查可疑病例时,除了佩戴口罩外,还需要佩戴护目镜。

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/doi/abs/10.1002/jmv.25725

医院病房空气中检出新冠病毒

SARS-CoV-2的爆发给医院环境卫生和医务人员保护带来了前所未有的挑战。对医院环境卫生进行评估,了解最重要的环境问题,对于控制病毒在医院的传播至关重要。

近日,吉林大学第一医院研究人员发现医院内疑似病人隔离区、护士站表面和重症监护病房空气中均能检测到病毒。该结果发表在medRxiv平台。

该研究对医院引导站、发热门诊、隔离病房的空气以及物体表面采样进行病毒核酸的检测。采用自然沉降法和空气颗粒采样器采集空气中的病毒,并于每天早上7点消毒前用棉签对预定的环境表面进行取样,近距离接触的医务人员的样本为咽拭子样本。采用实时定量PCR方法证实SARS-CoV-2是否存在。

结果发现,疑似病人隔离区护士站表面和重症监护病房空气中均能检测到病毒。作者表示,疫情期间医院环境卫生综合监测将有利于医院感染控制的进一步完善,对保证医疗安全和医院感染控制质量具有重要意义。

文章链接:

/content/10.1101/.02.25.20028043v1

(注:medRxiv平台文章为预印本,没有经过同行评审,其中结论尚未评估,不应用于指导临床实践)

第40期前沿报道到此结束

编辑:唐强虎 审校:方琪

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