原创： 生信菜鸟驿站 -06-21
1.公司返回的测序文件
16s测序数据公司反馈的文件包括几种，比如：
一般Excel表格里面呈现的是测序进度、有无条带和测序成功与否的结果。
另一个文件则是对应样本的峰图和碱基序列（公司一直强调：最好以峰图导出的序列为准）。
峰图用什么软件打开，我上篇文章已经提到了，大家可以翻上去看看。
文件类型其实主要还涉及：
前期给出的是两个引物各自分开的序列/峰图；
最后会给出拼接之后的文件。
如果需要自己拼接，请点击阅读原文中的文章。
PS：由于测序技术还有不足，每个测序反应一般仅有800bp左右比较准确。
一般测序结果的前端大约50个碱基的质量会不好(测序引物的原因)，此部分测序峰图通常无法判读。这是正常现象，需要把此部分碱基切除。同理，测序后期的碱基质量也比较差(酶活降低与杂质干扰较大等原因)，也需要把尾部测序峰图不规则的碱基切除。因此留下中间碱基质量相对较好(峰图规则)的序列用于后续分析。
（来自阅读原文）
2.得到拼接序列之后怎么办？
得到拼接序列之后，只需要点击参考文摘3的网址进入即可：
3.直接输入上面的拼接序列即可：
点击submit即可。
4.搜索结果如下：
5.依据域界门纲目科属种选择之后下载序列：
参考文摘：
1.力基因学堂
2.https://mp./s?__biz=MzUzMjEyMDE1NA%3D%3D&mid=2247483879&idx=1&sn=14e457cca3670af3eca4eec2bb050be1&scene=45#wechat_redirect
3.http://rdp.cme.msu.edu/classifier/classifier.jsp
阅读原文
