鱼塘经过修整后，可根据当地实际情况，选择适当药物进行消毒处理，以杀死各种病原体，常用消毒药物有生石灰、漂白粉、茶枯和巴豆等，以生石灰的消毒效果最好。
下面我们介绍怎样用生石灰、漂白粉、茶枯和巴豆给鱼塘消毒，供参考。
1、生石灰消毒
生石灰遇水后会产生强碱故有很强的灭菌及杀死敌害能力。在苗种放养前半月左右，选择晴天采用生石灰消毒。
消毒时，鱼塘需留水7－10公分，以便撒入的生石灰能均匀分布。生石灰用量，一般每亩60－75千克，淤泥少的鱼塘则用50－60千克。
生石灰不仅可杀灭池中的野杂小鱼、蛙卵、蝌蚪、螃蟹、蚂蟥、毒苔等水生生物，而且可消灭鱼类的致病细菌、寄生虫，同时还可改良池底土质，提高土壤的肥力。
2、漂白粉消毒
漂白粉一般含氯量在30%左右，经潮湿分解放出次氯酸和碱性氯化钙，有强烈的杀菌作用，但在肥水中药效会减低，而且消失也快，对急于使用的池塘较为适宜。
一般每立方米水体用漂白粉20克，将漂白粉加水溶解后，立即遍酒全池。
漂白粉在空气中极易挥发和分解，须密封贮藏，隔绝空气。应贮藏于阴凉干燥的地方，以免失效，使用时应戴上口罩，在上风处泼酒药剂。
3、茶枯消毒
水深一米的池塘，每亩需茶枯八十至一百斤。在天气炎热的季节里使用时消毒作用较大。如果茶枯质量差，天气太冷，茶枯用量应适当增加。
使用时，先将茶枯打碎，加水浸泡二、三天。如果茶枯块较大或质量差，应延长浸泡时间。浸泡后的茶枯浆用瓢遍酒全池，过一小时后，害虫狂窜乱游而死亡。
茶枯消毒，冬季可在晴天中午以前进行为宜，夏秋季可在清晨趁害鱼浮头时进行。
茶枯的作用次于生石灰，一般可杀死鱼、虾、昆虫，但不能杀灭水生植物如青苔、水绵，对有害的细菌和藻类反而能促进其生长。
4、巴豆消毒
先将巴豆捣碎浸泡，然后经水磨2次~3次，越细越好，也可先将巴豆磨碎，加3％食盐水，搅匀后盛放在坛内，密封两三天后使用。
巴豆对人畜有害，操作时要站在上风处泼酒，以免中毒。
巴豆只能杀死野杂鱼，对寄生虫、细菌、水生植物均没有杀灭作用。
