热应激(Heat stress, HS)严重影响母猪泌乳性能,然而,关于HS通过下丘脑-垂体-乳腺轴(HPMA)影响雌性动物泌乳性能的机制,信息有限。长链非编码RNA (Long non-coding RNAs, lncRNAs)在转录和转录后调控中发挥重要作用。但是,lncRNA在母猪下丘脑-垂体-乳腺轴上表达影响泌乳性能的机制尚不清楚。因此,本研究对热应激和热舒适条件下哺乳母猪的下丘脑、垂体和乳腺组织进行了RNA测序和生物信息学分析,结合转录组分析揭示HPMA对HS的响应机制,探讨热应激诱导哺乳期母猪泌乳的深层次原因。
技术路线
研究结果
HPMA(下丘脑-垂体-乳腺轴)中的鉴定表达分析
使用|log2Fold Change| > 1和Pvalue <0.05作为差异基因筛选标准,分别在不同处理下的下丘脑、垂体和乳腺,鉴定到差异表达的mRNA和lncRNA,并通过venn图,展示下丘脑、垂体和乳腺在热应激下共有的差异表达基因(图1)。聚类分析确定HS和TC条件下DE lncRNA和DE mRNA的表达模式,DE LncRNA和DE mRNA的热图显示三个组织中TC组和HS组分别明显分离(图2)。