病菌主要以菌丝、厚垣孢子或菌核在未腐熟的有机肥或土壤中越冬。在土壤中可存活6～。病菌可通过种子、肥料、土壤、浇水传播。以堆肥、沤肥传播为主要途径。
西瓜枯萎病是一种土传病害，主要在土壤和病残体上越冬，通过带菌种子、土壤、肥料、灌溉水、昆虫及人为传播。该病菌存活能力强，一般在旱田中可存活以上，甚至在通过牲畜消化道后依然可以存活。一般夏西瓜6月中下旬开始发病，7月份中旬至8月份上旬为发病盛期。
病菌在土壤中和未腐熟的带菌肥料中越冬，在离开寄主的情况下，能存活5－6年，部分病菌可存活以上。西瓜枯萎病菌主要通过根部伤口或根毛顶端细胞间隙侵入。
病菌主要以菌丝体、厚垣孢子或菌核在未腐熟的有机肥和土壤中越冬，分生孢子也可附着在种子表面越冬。病菌从根部伤口或根毛顶端侵入寄主薄壁细胞间和细胞内，再进人维管束，阻塞导管，干扰新陈代谢，导致西瓜萎蔫，中毒枯死。
西瓜枯萎病是一种土传病害，主要在土壤和病残体上越冬，通过带菌种子、土壤、肥料、灌溉水、昆虫及人为传播。
